O Núcleo de Apoio Psicopedagógico (NAP) realiza um trabalho de prevenção e intervenção com atendimento pedagógico, psicológico e psicopedagógico com o objetivo de melhorar a qualidade de vida do estudante e o processo de aprendizagem.
As atividades preventivas realizadas pelo NAP incluem palestras, oficinas, rodas de conversa com temas relevantes para o desenvolvimento intelectual e emocional dos estudantes e familiares para que seja colaborativa a aprendizagem dos alunos, começando na educação infantil e se estendendo até o ensino médio. O maior objetivo é eliminar as barreiras que possam impedir o processo de escolarização dos estudantes com especificidades, para não interferir negativamente em sua aprendizagem e bem-estar.
A Escola Conexão Aquarela, através da inclusão dos alunos que apresentam necessidades educacionais especiais na rede regular de ensino não consiste apenas na permanência física junto aos demais educandos, mas representa a ousadia de rever concepções e paradigmas, bem como desenvolver o potencial desses educandos, respeitando suas diferenças e atendendo suas necessidades.